Continuant l'enquête et tirant parti de la liste cachée retrouvée après le sabotage du dépôt des scellés, la DEA commence à se pencher sur les finances et les partenaires professionnels de Gus, ce qui met la pression sur ses anciens collaborateurs. Les autorités se concentrent sur la Madrigal Electromotive, une société allemande dans laquelle Gus avait des parts. La mystérieuse Lydia, son ancien contact dans cette société, rencontre Mike afin de savoir si ses anciens subordonnés incarcérés sont parfaitement fiables. Mike lui assure qu'ils ne parleront pas, Gus ayant prévu une prime pour acheter leur silence en pareil cas, et refuse catégoriquement sa proposition de les faire exécuter ; mais Lydia n'est pas convaincue, et décide de payer un autre associé pour éliminer les onze hommes, ainsi que Mike afin de se protéger elle-même. Walt, souhaitant reprendre au plus vite la production de méthamphétamine, espère rallier Mike à sa cause. Interrogé par Hank, de plus en plus près de découvrir la vérité, celui-ci n'a pas d'autre choix que d'accepter. En effet, la DEA a mis la main sur tous les comptes off-shore des employés de Gus et a saisi tout leur argent, les privant ainsi de leur prime de risque. Mike, qui avait de son côté placé 2 millions de dollars pour sa petite fille, se retrouve donc contraint de reprendre le trafic. De son côté, Skyler, terrorisée par la voie qu'a choisi de suivre son mari, s'en éloigne un peu plus chaque jour.

Sur le parking d'un café, Todd informe Walt par téléphone qu'il a repris, avec son oncle, les affaires autour de la méthamphétamine bleue, à la suite d'un « différend » avec Declan. En salle d'interrogatoire, Hank retrouve Jesse. Il lui propose de l'aider, de faire en sorte qu'il puisse repartir libre s'il lui dit tout ce qu'il sait sur Walt, mais le jeune homme, n'appréciant guère Hank, refuse toujours de parler. Marie, de son côté, tente une nouvelle fois de faire venir Walter Junior chez elle, prétextant un problème d'ordinateur. Prenant les devants, Walt avoue à son fils le retour de son cancer afin de le culpabiliser de sorte qu'il reste à la maison pour la soirée. Ne voyant pas son neveu arriver, celle-ci pousse Hank à tout révéler à ses supérieurs. Mais Hank souhaite toujours avoir des preuves solides avant d'inculper Walt. Marie, Hank, Skyler et Walt se retrouvent tous au restaurant, dans une ambiance extrêmement tendue, afin de discuter de la situation. Les deux derniers nommés souhaitent que leurs enfants soient laissés en dehors de tout ça, mais Hank affirme être prêt à aller jusqu'au bout, quoi qu'il en coûte. Aucun compromis ne sera trouvé entre les deux familles autrefois très proches et aujourd'hui en guerre. En partant, Walt donne un DVD à son beau-frère, le DVD de ses « aveux ». En le visionnant, Hank s'aperçoit qu'il ne s'agit absolument pas d'une confession, mais d'un piège. En effet, le chimiste y affirme que Hank a, grâce à son statut et ses relations à la DEA, monté un véritable empire de la drogue dont Walt n'était qu'un pion, contraint par la force et l’argent de préparer de la méthamphétamine. Walt affirme aussi que son beau-frère a enlevé ses enfants durant des mois pour l'obliger à se taire, qu'il a été contraint de payer les soins de celui-ci avec l'argent de la drogue à la suite de sa tentative d'assassinat par le cartel, ou encore de fabriquer une bombe artisanale pour que Hank se débarrasse de son ancien associé, Gustavo Fring. Hank, complètement abasourdi devant cette vidéo, mesure toute l'ampleur du machiavélisme de son beau-frère, et réalise qu'il pourrait bien tomber pour complicité à cause de l'argent que Marie a effectivement reçu de Skyler lors de son hospitalisation, chose qu'il ignorait. Dans une impasse totale, mais aussi dans la crainte que Walt ne diffuse ce DVD à grande échelle, il ne sait plus quoi faire. Dans le désert, Walt retrouve Saul et Jesse, fraîchement sorti de garde à vue. Il propose à son ancien partenaire de prendre une nouvelle identité pour quitter la ville au plus vite. Hésitant, car craignant que Walt ne le manipule une fois de plus ou ne décide de le supprimer, Jesse accepte finalement sa proposition, en larmes. Saul organise tout pour ce nouveau départ et son garde du corps accompagne Jesse à l'endroit où il doit rencontrer l'homme qui va le relocaliser. Mais, en fouillant dans ses poches, Jesse s'aperçoit que son pochon de marijuana a disparu. Il comprend alors que Huell le lui a subtilisé en douce, sous l'ordre de Saul, afin de ne pas compromettre l'opération ; il fait alors rapidement le rapprochement avec la disparition inexpliquée de sa cigarette contenant une fiole de ricine, des mois plus tôt, alors qu'il s'était rendu au cabinet de l'avocat, juste avant que le petit Brock ne soit empoisonné. Refusant de monter dans le véhicule qui repart sans lui, le jeune homme, furieux, retourne alors au cabinet de Saul, le frappe violemment, puis le menace avec une arme afin qu'il lui avoue tout sur cet épisode nébuleux. L'avocat confirme alors les soupçons de Jesse : à l'époque, Walt lui avait effectivement demandé de récupérer la cigarette contenant la ricine dans ses poches pour faire porter la responsabilité de l'empoisonnement de Brock sur Gus Fring (alors que le responsable est Walter, avec du muguet), afin de convaincre Jesse de coopérer à l'assassinat de Gus. Une fois son calvaire terminé, Saul prévient Walt de la situation. Ce dernier passe alors rapidement récupérer un pistolet caché à la station de lavage. Littéralement bouleversé de rage, Jesse se précipite au domicile de la famille White, s'introduit dans la maison et y vide un bidon d'essence.