Los detectives de la policía de Boston Nick Walker y Bobby Hayes roban oro durante una redada de drogas. Nick lamenta el robo y le dice a Hayes que lo entregará como evidencia. Hayes dispara y mata a Nick en la próxima redada de drogas. El tiempo se detiene alrededor de Nick y es arrastrado a un vórtice, depositándolo en una oficina. Nick conoce a Mildred Proctor, quien le explica que está muerto y que se dirigía al juicio. Ella lo recluta en el R.I.P.D., cuyo trabajo es encontrar y capturar a Deados, las almas de las personas que murieron pero escaparon del juicio. Nick está asociado con Roicephus "Roy" Pulsipher, un legislador del Viejo Oeste. Roy lleva a Nick a ver su propio funeral y Nick habla con su esposa Julia, pero ella no lo reconoce. Roy explica que a los oficiales de R.I.P.D. se les cambia su apariencia y se les impide revelar sus verdaderas identidades. Nick ahora aparece como un anciano asiático, mientras que Roy parece ser una hermosa mujer rubia.
Tras internarse en Emyn Muil, Frodo Bolsón y Sam Gamyi se encuentran con la criatura Gollum, que intenta quitarles el Anillo por la fuerza pero, al verse vencido, promete a los hobbits guiarlos hasta Mordor. Tras sacarlos de Emyn Muil y atravesar la Ciénaga de los Muertos, llegan al Morannon, la «Puerta Negra» de Mordor. No obstante, la gran protección que tiene les imposibilita entrar por ahí y Gollum les propone tomar el camino secreto de Cirith Ungol. Durante el viaje, se encuentran con una tropa avanzada de montaraces de Gondor dirigida por Faramir, hijo del senescal de Gondor y hermano de Boromir, quien los toma como prisioneros y descubre que portan el Anillo Único. Faramir cuenta a los hobbits que Boromir ha muerto y que fue encontrado en un bote élfico. Esto hace pensar a Frodo, pues creía que Boromir solo quería el Anillo, y por su hermano descubre que murió protegiendo a la Compañía, tal y como habían jurado todos sus miembros al salir de Rivendel. Faramir decidió llevarlos ante su padre, pero, a su paso por la derruida ciudad de Osgiliath, los soldados gondorianos se encuentran combatiendo a las fuerzas de Sauron conducidas por algunos Nazgûl. Al darse cuenta del maligno poder del Anillo sobre Frodo, al que casi captura uno de los Nazgûl, Faramir decide liberarlos para que completen su misión.
Wade Wilson es un mercenario que pasaba su tiempo en la ciudad de Nueva York protegiendo a las adolescentes de los posibles acosadores y asistía a un bar en el que los ebrios solían organizar peleas denominadas Pozos de la Muerte. Una noche en el bar, Wade conoce a Vanessa Carlysle y se convierten en novios por casi un año, durante ese tiempo deciden celebrar su amor, teniendo relaciones sexuales en todas las festividades (excepto en la Pascua de Resurrección). Cuando estaban teniendo relaciones sexuales una noche de Navidad, Wade le propone matrimonio a Vanessa, luego de repente se derrumba y es diagnosticado con cáncer terminal aligado a los pulmones, próstata y cerebro, lo que hace prácticamente imposible la operación. A pesar de que Vanessa decidió no rendirse y buscar soluciones, Wade solo quiere aprovechar el poco tiempo que le queda.
Siguiendo los hechos de The Matrix: Reloaded, se muestra a la flota de Sion destruida casi por completo (sólo quedan dos naves, la Hammer y la Logos), Neo (Keanu Reeves) en un estado de coma y el agente Smith (Hugo Weaving) adueñado del cuerpo de Bane (Ian Bliss) aparentemente también. La tripulación de Nabucodonosor rescata a Neo del letargo en el que se encuentra, similar a una conexión a Matrix, pero sin cables. La tripulación del Hammer, al mando de Roland, se muestra a la espera de la nave Logos, y extrañados tanto de la supervivencia de Bane como de las acciones de Neo, que no habían llevado al final de la guerra como se esperaba. Link al rato contesta una llamada de Seraph (Collin Chou) quien enviado por el Oráculo solicita ver a Trinity (Carrie-Anne Moss) y Morfeo (Laurence Fishburne).
La historia comienza con un recuerdo de cómo el hobbit Smeágol llegó a poseer el Anillo de Poder, tras matar a su amigo Déagol, quien lo había encontrado en el fondo de un río (donde cayó muchos años antes, como se vio en la primera película, cuando unos orcos asesinaron a Isildur, quien había cortado el dedo a Sauron en el Sitio de Barad-dûr, que concluyó la Guerra de la Última Alianza, y había conservado el Anillo a pesar de las advertencias de Elrond). A partir de entonces continúa el relato en donde se dejó mientras Gollum lleva a Frodo y Sam a través de la entrada cercana a Minas Morgul, en donde ven a sus ejércitos partir a la guerra.
Thomas Anderson es un programador informático de día y un hacker llamado Neo de noche. Lleva toda su vida intuyendo que hay algo más, que hay algo que falla y esa duda se ve reafirmada con un mensaje recibido en su ordenador: «Matrix te posee». Así, Neo comienza la búsqueda desesperada de una persona de la que solo ha oído hablar: otro hacker llamado Morfeo, alguien que puede darle la respuesta a las preguntas que persigue: ¿Qué es Matrix? y ¿por qué lo posee a él?
En 1980, en la Tierra, Missouri, Meredith Quill va de paseo en auto con un hombre, que resulta ser una persona que viene del espacio exterior, mientras están en una cita, este le muestra a Meredith una de las semillas plantadas y le menciona que son el futuro. De vuelta en la actualidad, Peter Quill, Gamora, Drax, Rocket y Groot son famosos como los Guardianes de la Galaxia. Ayesha, líder de la raza conocida como los soberanos, hace que los Guardianes protejan baterías valiosas de un monstruo interdimensional a cambio de la distanciada hermana de Gamora Nebula, que fue capturada intentando robar las baterías. Luego de que Rocket roba algunas para sí mismo, los soberanos atacan la nave de los Guardianes con una flota de drones. Estos son destruidos por una figura misteriosa, y los Guardianes se estrellan en un planeta cercano. Allí, esta figura se revela como el padre de Quill, Ego, e invita a Quill, Gamora y Drax a su planeta natal. Rocket y Groot se quedan atrás para reparar la nave y vigilar a Nebula.
Ocho años después de la muerte del fiscal de distrito Harvey Dent y de los horribles y sangrientos eventos en Gotham City, la «Ley Dent» le garantiza poderes al Departamento de Policía de Gotham City, que casi ha erradicado el crimen organizado de la ciudad. Mientras tanto, en Extremo Oriente, tres ladrones son interrogados en un avión por agentes de la CIA para saber el paradero del peligroso terrorista Bane; sin embargo y para sorpresa de los agentes, entre los prisioneros se encuentra el propio Bane, quien les revela que su plan consistía en que lo atraparan para poder capturar al doctor Leonid Pavel, un renombrado físico nuclear, quien también estaba en el avión. Después de eso, el avión donde viajaban los agentes es derribado y éstos son asesinados por los secuaces de Bane, no sin antes llevarse con vida al doctor Pavel y hacer que todo parezca un accidente de avión.
Después de haber adquirido la Gema del Poder que había quedado bajo custodia de los Nova Corps en el planeta Xandar, el malvado titán intergaláctico Thanos, intercepta la nave espacial que transportaba a los sobrevivientes de la destrucción de Asgard y la ataca. Durante el asalto a la nave, Thanos y sus lugartenientes, Ebony Maw, Cull Obsidian, Próxima Midnight y Corvus Glaive, exterminan a la mitad de la tripulación. Thanos somete a Thor y amenaza a Loki con matar a su hermano adoptivo si no le entrega el Teseracto, al principio Loki finge que no le importa la vida de su hermano, pero al ver la determinación de Thanos, cede ante la presión y le muestra el Teseracto para ganar tiempo hasta que llega Hulk y comienza a pelear contra el guerrero extraterrestre, no obstante, el titán demostró tener más habilidad en la lucha mano a mano y derrota rápidamente a Hulk. Al ver esto, Heimdall quien yacía malherido en el suelo, usa lo que le queda de energía oscura para enviar a Bruce Banner / Hulk de regreso a la Tierra invocando el Bifröst, eso enfadó a Thanos y en represalia asesina a Heimdall. Luego extrae la Gema del Espacio del Teseracto y mata a Loki. Una vez que cumple su cometido, Thanos se va con sus lugartenientes y destruye la nave espacial.
En el siglo XVI, los conquistadores españoles liderados por Don Aguirre viajan a Sudamérica en busca de las Lágrimas de la Luna, un árbol mítico cuyos pétalos pueden curar cualquier enfermedad, curar cualquier herida y levantar cualquier maldición. Después de que la mayoría de los hombres mueren en la jungla, una tribu local cuida a los sobrevivientes para que recuperen la salud utilizando los pétalos de los árboles. Cuando se niegan a revelar la ubicación del árbol, los españoles destruyen la aldea. Como castigo, los conquistadores fueron maldecidos por el jefe de la aldea para que nunca murieran y nunca pudieran dejar de vista el río o la jungla los llevaría de regreso a él por toda la eternidad.