Peter Treiber, le légiste de l'hôpital (que tous détestent car il répertorie leurs erreurs de diagnostic et les rend publiques) s'ouvre lui-même le crâne avec son scalpel lors d'une autopsie.
Après la mort de Joe dans l'épisode précédent, House veut lui faire une autopsie pour découvrir ce qu'a Foreman, mais Cuddy refuse. House donne alors à Foreman le matériel d'autopsie mais ce dernier est devenu aveugle comme Joe, bien qu'il croie voir. En attendant de trouver une vraie solution, House le traite pour tout. Cameron retourne chez lui, suivie de près par House. Rodney Foreman, le père d'Eric, fait son apparition. House s'en sert pour manipuler Cuddy et faire l'autopsie, mais cela ne marche pas. Foreman voit de nouveau mais les médicaments souillent son pancréas. House retourne à l'appartement avec Steve McQueen, son rat, et retrace le parcours de Foreman. Le rat peut paraître euphorique, mais il ne présente aucun autre symptôme. La maladie progresse plus vite chez Foreman que chez Joe ; pensant que c'était la légionellose qui ralentissait la maladie inconnue, House l'inocule à Foreman, redevenu aveugle peu de temps avant.
Rebecca Adler, institutrice de maternelle de 29 ans, est soudain prise d'une crise d'aphasie devant sa classe. Elle a juste le temps d'écrire « Call the nurse » (« Appelez l'infirmière ») avant de se mettre à convulser. Elle est envoyée à l'hôpital de Princeton-Plainsboro, où son cas est suivi par le docteur Gregory House. Son ami, l'oncologue James Wilson, affirme qu'elle ne réagit pas à la radiothérapie pour une tumeur au cerveau. Mais au moment où Adler doit passer une IRM, Lisa Cuddy, directrice de l'hôpital, l'en empêche car elle veut que House reprenne les consultations. Finalement House acceptera, à contrecœur. Adler passe finalement l'IRM mais elle manque de s'asphyxier car elle est allergique au gadolinium, produit de contraste utilisé en IRM. Elle subit une trachéotomie. House commence les consultations, et durant l'une d'elles, il pense à mettre Adler sous corticoïdes pour une éventuelle vasculite. Mais après amélioration de son état, celui-ci empire : elle perd la vue avant de convulser. Les docteurs Eric Foreman et Allison Cameron vont chez elle et « ne trouvent rien, à part du jambon ». Si Foreman n'y voit que le mensonge de Wilson, qui prétendait que la patiente était sa cousine (elle n'est pas juive), House retient la mention du jambon, qui lui permet de deviner la Neurocysticercose. Cependant, Adler ne veut plus être traitée sans certitude. House ne parvient pas à la convaincre de continuer à vivre, certain de son diagnostic. Heureusement, Robert Chase propose une radio pour trouver le ver. Sur conseil de House, une radio de la cuisse est faite et révèle le parasite. Sous traitement, Adler récupère doucement.
En consultation, House tombe sur un homme à la peau orange dont il soupçonne la femme d'avoir un amant, puis sur un garçon de dix ans souffrant d'asthme et enfin sur un homme victime du syndrome de fatigue chronique.
Un artiste peintre fait un portrait d'une femme, mais elle et son mari s'énervent car le peintre, Brandon, a fait un portrait déformé. En fait il a une agnosie visuelle. Douglas a une petite attirance pour Cuddy, qui refuse de régler les honoraires du détective. Les enquêtes de ce dernier révèlent que Taub a un compte en banque secret. En fait sa femme a dépensé les 83 000 dollars qui se trouvaient dessus pour lui acheter une voiture. Brandon révèle ce que House suspectait : pour compenser les rares ventes de ses œuvres, il fait des essais cliniques, mais ne veut pas que sa femme le sache, car il croit que cela va la peiner. Soudain, son visage et sa gorge enflent et il a besoin d'une trachéotomie. Son agnosie visuelle revient quand il voit des inconnus, en réalité "Numéro 13" et Taub, qu'il a déjà vus. Bien que son organisme ait été désintoxiqué deux fois des médicaments expérimentaux qu'il prend, son état s'aggrave. Taub se rend à son atelier et apprend que l'agnosie visuelle est périodique : 1 mois sur 2. En se souvenant que le premier médicament qu'il a pris est un anti-acide, House demande qu'on lui fasse une chirurgie abdominale pour lui retirer un pharmacobézoard : il a grossi au fur et à mesure de ses repas et de ses prises de médicaments, suintant parfois. House apprend que l'enquête de Douglas sur Cuddy s'est révélée infructueuse.
Pendant un rendez-vous avec son amant, Julia, 35 ans, reçoit la visite de son mari, qui n'est pas gêné : ils vivent une union libre. Mais peu après son départ, Julia ressent une douleur intense à l'estomac.
"Numéro 13" utilise habilement le mode de vie amoureuse de la patiente pour que House, mais aussi toute l'équipe, s'intéresse au cas.
House tente de provoquer une dispute entre Sam et Wilson, en jouant sur ce qui irrite son ami : ses manies sur l’entretien et la nourriture, comme le lait dans la porte au lieu du milieu du réfrigérateur.
Une fois au courant du cas de Julia, House cherche un diagnostic, prétexte à la garder. Il trouve l’herpès dans le colon pour la rencontrer et la tester par radio avec un lavement baryté. Taub est convaincu que le libertinage est une utopie dans le couple. Toutefois, quand "Numéro 13" le voit en train de flirter avec Maya, une infirmière, elle lui rappelle ses propos et désapprouve son comportement.
Un jeune couple prend du bon temps dans une voiture, quand soudain le garçon, Steevy, a une crise hypoxique. Quand House arrive sur le parking de l'hôpital, il découvre avec horreur que J. Whitner, une nouvelle chercheuse, a pris sa place. Et pour cause : elle est en fauteuil roulant. La rencontre est assez froide. Foreman veut que les parents de Steevy signent l'autorisation de la veinographie. Mais il dit qu'ils sont en conférence. Mais une nouvelle crise de Steevy oblige Foreman à faire la veinographie. Il découvre que Steevy est plutôt bon en sciences. Chase et Cameron vont chez lui mais tombent sur un couple qui ne le connaît pas. La petite amie de Steevy révèle alors qu'il a menti car il est rom, et donc ne fait pas trop confiance aux gadjos. House exige auprès de Cuddy de récupérer sa place. Un pari est fait : si House tient une semaine en fauteuil roulant, il aura gain de cause. Foreman fait une artériographie à Steevy avec Cameron, mais soudain le cœur du garçon s'emballe. Son foie est détérioré. Lors de son IRM, ses parents font irruption. On pense à la maladie de Wegener. Lors d'une altercation entre la petite amie et les parents, l'état de Steevy s'aggrave : hémorragie de la vessie. House veut lui donner du FT 28, mais les parents pensent que les médecins vont faire des expériences médicales sur Steevy. Foreman veut le donner en cachette, mais Steevy refuse et son état s'aggrave encore. On l'opère, mais aucun granulome n'est repéré. Celui repéré dans le foie était en fait du tissu cicatriciel. House palpe son intestin grêle, sans résultat. House veut, après un petit jeu (morpion) sur les hémorragies et les caillots, lui faire une coloscopie. Et c'est dans le côlon que se trouve le problème : une indigestion d'un cure-dent avalé par accident, perçant à travers l'intestin les organes proches. Foreman propose à Steevy de travailler à l'hôpital, mais il préfère travailler avec ses parents. House réclame sa place mais Cuddy a appris qu'il s'était levé lors de l'opération de Steevy, en fait elle n'avait jamais l'intention de la lui rendre. Comme elle a mauvaise conscience, elle la lui rend quand même. House s'occupe aussi d'un jeune homme atteint de maux de gorge.
Le couvreur mexicain de Cuddy, Alfredo, tombe soudain de son toit. Cuddy l'amène à l'hôpital. House pense à une CIVD. Le diagnostic et les méthodes de Cuddy sont totalement axés sur la culpabilité. Cameron et elle vont chez Alfredo, tandis que House, Chase et Foreman vont chez Cuddy. Cuddy et Cameron trouvent un rat mort, tandis que House trouve des champignons sur le tuyau de l'évier de Cuddy. Une fièvre de la morsure de rat (streptobacillose) est mise en évidence et Cuddy suggère la protéine C pour le soigner. Voyant que cela a des effets secondaires néfastes, il est traité pour une pneumonie fongique causée par l'aspergillus trouvé sous l'évier de Cuddy. Mais la main droite d'Alfredo, un peu assombrie dans l'ambulance, est devenue nécrosée, pratiquement morte maintenant : c'est la gangrène. Une amputation est faite, mais la main gauche devient noire. Cuddy avait omis de signaler les problèmes respiratoires d'Alfredo. House pense à une endocardite bactérienne, mais le test est négatif. House en déduit néanmoins le diagnostic, une psittacose : le samedi soir, Alfredo travaille dans une ancienne usine désaffectée où ont lieu maintenant des combats de coqs. Il est traité et guéri mais poursuit l'hôpital devant les tribunaux pour l'amputation. En consultation, Foreman énerve un patient Afro-Américain quand il refuse de lui donner un traitement réservé aux personnes de type caucasien. Par la ruse, House feint de lui donner le bon traitement.
Il y a près de deux siècles, un navire hollandais coulait près des côtes des États-Unis avec son chargement d'esclaves. De nos jours, une adolescente fait de la plongée et remonte un bocal du bateau naufragé, qui se brise. Quand elle tombe malade, les premiers symptômes indiquent qu'elle a la variole, mais House a des doutes sur le diagnostic.
Une naissance a lieu au Princeton-Plainsboro. Pendant ce temps, Chase est bipé dans le hall d'entrée : Cameron veut le voir et lui parler en privé, à propos notamment des papiers du divorce. Quand le jeune père remarque l'absence de son enfant, Cuddy ordonne la fermeture de l'hôpital et la situation d'urgence, puisqu'apparemment, le bébé est encore dans les murs. Elle demande à tout le personnel de rester dans une pièce fermée pendant qu'elle se joint aux recherches.
House, qui essayait d'esquiver les policiers, s'enferme dans une chambre, mais y trouve un patient mourant d'une cardiomyopathie ischémique. House reconnait le dossier, qu'il avait refusé de prendre.
Une adolescente de 16 ans se met à suffoquer à cause d'un œdème pulmonaire à l'usine où elle travaille. Foreman demande à faire des essais cliniques mais House refuse. La fille, fraîchement émancipée, fait un épisode psychotique. Elle prétend qu'elle ne prend pas de drogue, ce qui est vrai, mais aussi que ses parents sont morts, ce qui sera contredit par une IRM. Elle dit que son père l'a violée par le passé et que sa mère a sciemment ignoré la situation. House pense que de l'arsenic échappé de ses meubles en bois a causé ses symptômes. Le traitement par chélation marche. De son côté, Foreman traite seul le cas de Jonah, un petit garçon qui est soudain pris d'une crise de fou-rire. Il demande l'aide de Cameron et Chase pour poser son disgnostic. L'état de Sophia, patiente de l'équipe, empire malgré la chélation. "Numéro 13" diagnostique une leucémie promyélocytique. Elle a besoin d'une greffe de moelle osseuse mais refuse la moelle de ses parents, ne voulant pas avoir de dette envers eux. "Numéro 13" apprend que Sophia a usurpé l'identité d'une autre tandis qu'elle cherchait ses parents. Sophia finit par révéler à House qu'elle a tué accidentellement son frère cadet qu'elle devait surveiller. House la raisonne, elle appelle ses parents et survit grâce à la greffe. Foreman remarque qu'Evan est très protecteur envers Jonah, et découvre qu'il lui a donné plus de vitamines que nécessaire afin de le fortifier, ce qui a provoqué une accumulation trop importante de fer dans son organisme. Evan a peur de la rancune de Jonah mais il n'en est rien, à la grande joie de Foreman, qui voit les deux frères sortir de l'hôpital heureux et plus complices que jamais.