Captain Future empfängt einen Hilferuf vom Planeten Katain. Dieser befand sich einst zwischen Mars und Jupiter. Future, Grag, Otto und das lebende Gehirn Simon reisen hundert Millionen Jahre in die Vergangenheit, um den Bewohnern von Katain zu helfen. Captain Future erfährt bei der Ankunft auf Katain, dass der Planet in zwei Monaten untergehen wird. Um die Bevölkerung zu evakuieren, muss Future ein seltenes Metall beschaffen. Als die Future-Crew deshalb noch drei Millionen Jahre weiter in die Vergangenheit reist, gerät die Zeitmaschine außer Kontrolle. Die Comet strandet in einer Zeit, in der es das Sonnensystem noch nicht gab. Ihr Energievorrat geht allmählich zu Ende. Es besteht keine Hoffnung, das für die Energieversorgung dringend benötigte Metall Takionium zu finden. Mit den letzten Reserven wagen Captain Future und seine Crew den Sprung in die Zukunft.
Joan und Ezella begleiten eine Gruppe von Häftlingen, die auf einen Gefängnisplaneten verlegt werden. Captain Future und seine Crew schließen sich an, da sie befürchten, dass die Gefangenen einen Fluchtversuch unternehmen könnten. Und tatsächlich übernehmen die Verbrecher unter Leitung von Kim Iwan das Raumschiff.
Die Geiseln an Bord des Gefangenentransporters fürchten um ihr Leben. Da der Pilot unerfahren ist, muss Captain Future eingreifen und notlanden. Doch sie sind noch längst nicht in Sicherheit: Der Planet droht in Kürze unterzugehen. Die Gestrandeten müssen schnellstens ein neues Raumschiff bauen, um sich zu retten. Professor Simon macht sich deshalb auf die Suche nach Metallen.
Captain Future ist mit seiner Crew und den Schwerverbrechern auf einem dem Untergang geweihten Planeten gestrandet. Gemeinsam bauen sie ein neues Schiff, um dem sicheren Tod zu entgehen. Doch sie brauchen Kalzium, um das Cyclotron zu kontrollieren. Und das scheint auf dem gesamten Planeten nicht vorzukommen.
Die Eismenschen, Wesen, die weder Luft brauchen noch eine Körpertemperatur haben, wollen auf dem Planeten Tarust die Macht an sich reißen. Die bedrohte Bevölkerung bittet Captain Future um Unterstützung. Der Captain sieht einem legendären Helden der Taruster verblüffend ähnlich. Future und seine Crew reisen nach Tarust und können dort in letzter Minute einen Sieg der Eismenschen verhindern. Doch der Preis dafür ist hoch.
Grag wurde während des Kampfes mit den Eismenschen gefangen genommen. Unterdessen klärt Captain Future die Herkunft der Eismenschen. Diese sind mutierte Taruster, die ursprünglich von einem Wissenschaftler erschaffen wurden. Unter Einsatz von Telepathie schleichen sich Future und seine Crew in die Stadt der Eismenschen ein.
Captain Future und seine Crew dringen in den Palast des Königs der Eismenschen ein. Dabei wird der Captain gefangen genommen, doch Future wird gefasst. Als er wenig später verhört wird, gelingt ihm die Flucht. Aus einem Buch erfährt er von einer Möglichkeit, die Eismenschen zu besiegen: Er muss sie mit UV-Strahlen beschießen.
Der Zauberer Kuolon ist mit fünf anderen Schwerverbrechern aus dem Gefängnis ausgebrochen. Gemeinsam wollen sie den größten Schatz der Geschichte aus dem Parallelraum bergen. Doch zum Flug in die fünfte Dimension fehlt ihnen noch eine größere Menge Radium. Captain Future ist dem Verbrecher bereits auf den Fersen. Er verfolgt seine Spur bis zum Planeten Almeria, wo es ein großes Radiumvorkommen gibt.
Captain Future ist Kuolon zum Planeten Almeria gefolgt. Nur dort wird genügend Radium abgebaut. In letzter Sekunde kann Future sich an Bord von Kuolons Raumschiff schmuggeln. Doch während des Fluges in die fünfte Dimension wird er entdeckt.
Captain Future wird in letzter Minute von seiner Mannschaft vor dem Ertrinken gerettet. Nun jagt die Comet hinter Kuolon her. Sie verfolgen seine Spur bis zu einem rätselhaften, unsichtbaren Planeten. Kaum ist die Crew gelandet, werden sie von den Bewohnern gefangen genommen. Im Gefängnis offenbart ihnen ein Wissenschaftler das Geheimnis des Planeten.
Gemeinsam mit den Wissenschaftlern Winters und Norton, will Captain Future mehr über das untergegangene Deneb-Reich herausfinden. Durch die Inschrift auf einer Grabplatte erfährt er, dass die Deneb in der Lage waren, die Evolution zu manipulieren. Norton und Winters wollen dieses Geheimnis unbedingt entschlüsseln, doch Future traut ihnen nicht und zerstört die Steinplatte. Die Wissenschaftler bringen daraufhin die Komet in ihre Gewalt.
Die Wissenschaftler Norton und Winters schließen sich einer Barbarenhorde an, die sich genetisch manipulierte Tiermenschen als Sklaven hält. Diese warten seit langer Zeit darauf, dass ein so genannter Urmensch sie wieder zurückverwandelt. Nachdem Future einem von ihnen das Leben rettet, unterstützen sie ihn, da sie hoffen, er können sie wieder zu Menschen machen.
Captain Future kann Joan und Ken befreien. Gemeinsam reisen sie zur Höhle des Lebens, wo sie das Geheimnis der Deneb vermuten und besiegen dort Norton und seine Barbarenhorde. In der Höhle stoßen Future und seine Freunde auf Kol und Atta, zwei Menschen, die zur Zeit des Deneb-Reiches die Tiermenschen erschaffen mussten.
Luft- und Wasserknappheit drohen das Leben auf dem Planeten Laguna unmöglich zu machen. Als die Bewohner evakuiert werden sollen, brechen Unruhen aus. Captain Future verspricht, den Planeten zu retten. Doch dazu benötigt er die sagenumwobene "Quelle der Materie". Gemeinsam mit seiner Crew macht er sich auf die Suche.
Captain Future und seine Mannschaft müssen auf dem Planeten Kol notlanden. Dort nimmt sie König Lulstan gefangen. Future soll Lulstans Raumschiffe aufrüsten, damit dieser seine Feinde vom Planeten Sulun besiegen kann. Als Gegenleistung will er ihm den Weg zur "Quelle der Materie" weisen. Währenddessen entdeckt Professor Simon im Kerker des Palastes eine Gefangene: Es handelt sich um Prinzessin Syria vom Planeten Solun.
Captain Future und seine Crew werden auf dem Planeten Solun freudig begrüßt. Sie haben Prinzessin Syria gerettet und ihrem Vater, König Quoroll, zurückgebracht. Als Quoroll erfährt, dass Future die Quelle der Materie sucht, reagiert er aber mit Misstrauen. Da startet der König von Kol einen Überraschungsangriff auf Solun.
Mehrere Raumschiffe verschwinden, darunter auch eines mit Ezella und Joan an Bord. Captain Future und seine Crew können in Erfahrung bringen, dass alle verschollenen Schiffe sich in der Nähe des Halleyschen Kometen befanden. Auf Halley angekommen entdeckt die Future-Crew, dass sich im Kern des Kometen eine Stadt befindet, die von Elektromenschen bewohnt ist. Diese nehmen die Crew gefangen und bringen Captain Future zu ihrem König, Solix.
Captain Future hält Kueldel für den wahren Herrscher über die Elektromenschen. Der jedoch bekommt den Befehl, die Häftlinge zu töten. Der Future-Crew gelingt es noch rechtzeitig zu fliehen und eine Feier zu stören, bei der sich die Elektromenschen mit Strom betrinken. Bei ihrem Versuch, Kueldel zu verhaften, wird Captain Future selbst gefasst und in ein ausbruchsicheres Gefängnis geworfen.
Captain Future trifft auf Elektromenschen aus der vierten Dimension, die es auf die Energie des Halleyschen Kometen abgesehen haben. Prompt nehmen sie ihn gefangen. Otto und Greg können ihren Freund zwar befreien, doch um sich dauerhaft vor den Feinden in Sicherheit zu bringen, muss sich Captain Future selbst in einen Elektromenschen verwandeln. Gelingt es ihm, die seltsamen Wesen wieder in die ursprünglichen Bewohner des Halleyschen Kometen zurückzuverwandeln?
Captain Futures Leben soll verfilmt werden. Die Produktionsfirma sucht mit Werbespots nach einem Hauptdarsteller. Präsident Cashew glaubt aber, dass Produzent Walden den Film nur als Vorwand benutzt, um eine große Menge Diamanten in seinen Besitz zu bringen. Er schleust Captain Future beim Casting ein. Prompt erhält der die Rolle. Auch Otto, Grag und Simon stoßen zum Produktionsteam und entdecken bald, dass Walden tatsächlich Übles im Schilde führt.
Produzent Walden entdeckt ein Abhörgerät, das Captain Future und seine Freunde angebracht haben. Er weiß nicht, dass sie ihn damit als Verbrecher überführen wollten. Dann reist das Filmteam zum Planeten Baimu, wo die Magier leben. Captain Future, der als Verkäufer namens Carson auftritt, soll eine Dreherlaubnis erwirken. Das bringt ihn in einen Gewissenskonflikt: Er ist mit den Magiern befreundet und will keinesfalls seine Tarnung aufgeben.
Die Magier decken die wahre Identität Carsons auf, wodurch Captain Futures Tarnung auffliegt. Kurz darauf greifen Waldens Leibwächter und aufbegehrende Minenarbeiter, als Stagäer verkleidet, das Filmteam an. Ihre Absicht ist es, den Stagäern zu schaden und somit an die Diamanten zu kommen. Mit Hilfe einer magischen Waffe können sie jedoch niedergeschlagen werden. Nun steht in New York die große Premiere des Films an.
Der interplanetarischen Raumfahrt droht eine Katastrophe. In nur fünf Bergwerken wird das für die Raumfahrt erforderliche Metall Gravium gewonnen. Drei wurden bereits von einem Mann namens Wrecker zerstört. Captain Future muss herausfinden, wer sich hinter Wrecker verbirgt.
Joan befindet sich in der Gewalt von Wreckers Leuten. Grag versucht, sie zu begreien. Captain Future muss die Zerstörung des Unterwasser-Bergwerks auf dem Planeten Bame verhindern. Es gelingt ihm, einen Gefolgsmann Wreckers gefangenzunehmen.
Captain Future hat sich in Wreckers Geheimbasis eingeschlichen, wird aber entlarvt. Seine Seele wird in den Körper eines Aqua-Wesens verpflanzt. Der falsche Captain nimmt unterdessen seine eigene Mannschaft gefangen. Als nächstes will Wrecker Joan einer Gehirntransplantation unterziehen.
Captain Future erhält einen brisanten Auftrag: Er soll Dealer festnehmen, die mit einem illegalen Verjüngungsmittel handeln. Sofort macht er sich zusammen mit Otto an die Ermittlungen. Bereits kurze Zeit später stoßen die beiden auf zwei Händler, die sie bis in eine mysteriöse Maschinenstadt verfolgen können. Dort setzt Captain Future alles daran, um den Dealern das Handwerk zu legen.
Captain Future fahndet immer noch nach den Dealern des Verjüngungsmittels. Dabei trifft er auf drei weitere Leute, die nach der Quelle des ewigen Lebens suchen: Biochemiker Gibbo, den Anthropologen Graem und einen Mann namens Keen. Währenddessen werden Otto und Joan, die ebenfalls die Dealer jagen, in einem entlegenen Haus eingesperrt. Captain Future kann sie befreien, doch der Drogenboss, Mr. Immortality, entkommt.
Mittlerweile sucht das ganze Future Team nach der Quelle des ewigen Lebens. Grag und Otto werden von Mr. Immortality, dem Boss der Dealer, gefangen genommen, während Captain Future und Joan so genannten Vogelmenschen in die Hände fallen. Die erzählen, dass die Süchtigen nahe der Quelle in einer Stadt des ewigen Lebens hausen. Dort feiern sie solange, bis am Ende alle Selbstmord begehen.