Han pasado dos años desde que los Transformers irrumpieran en la vida de Sam Witwicky. Ahora, el objetivo de Sam es ingresar en la universidad y llevar una vida tranquila, pero se ve otra vez involucrado en la guerra entre Autobots y Decepticons.
Una poderosa raza alienÃgena contrata a los Guardianes para que protejan sus valiosas baterÃas de energÃa, pero, cuando Rocket las roba, los alienÃgenas envÃan a sus tropas de combate a vengarse de los Guardianes. Mientras tratan de escapar con vida, intentan resolver el misterio de los verdaderos orÃgenes de Peter Quill.