Les héros embarquent pour l'île des Ténèbres et échappent de peu à une attaque de Mâchoires de Mer. Zane retrouve son père vivant mais prisonnier d'un terrible Leviathan. Il s'avère très difficile d'organiser son évasion.
Le serpent apocalyptique Wojira émerge de la mer monté par Kalmaar lui-même et fait presque chavirer un petit chalutier de pêche. Au port de Ninjago, Glutinous explique à un pêcheur qu’il doit parler aux ninjas et affirme qu’il a quelque chose d’urgent à leur dire. Wu convoque Zane, Jay, Nya et Benthomaar au poste de police où le commissaire les attend.
Les ninjas retournent sur l'île des gardiens pour les avertir du plan de Kalmaar. Ils convainquent leur chef de leur confier l'amulette de foudre pour la mettre à l'abri à Ninjago City, mais ils découvrent que celle-ci n'est qu'une copie. Soupçonnant Clutch Powers d'être derrière tout ça, les ninjas s'empressent de retourner au sous-marin et tombent dans une embuscade tendue par Kalmaar.