Ramiel est en train de forer la couche supérieure de Tokyo-3 pour atteindre le geofront avec le quartier général de la NERV en dessous. En face d'un puissant rayon d'attaque et un AT Field le plus puissant jamais observé, un assaut direct avec les Evas échouerait. Un plan est élaboré avec l'Eva-01 qui utilise un prototype avancé de canon à positron, fonctionnant avec l'électricité produite par tout le Japon, pendant que Rei avec son Eva-00 protège l'Eva-01.